bioedit&PrimerPrimer5的使用


生物信息学作业-520-bioedit&PrimerPrimer5

问答题:(1)分析所给核酸序列(基因)的组分,主要包括分子质量、碱基组成和碱基分布
等;(2)给出相应的转换,例如DNA 转换成RNA,翻译成蛋白质序列;(3)分析基因所包
含的限制性内切酶位点;(4)如何设计引物并将基因克隆到特定载体上(质粒,pET28a)?

>k127_305768_1
ATGAGCGCGAAGCCGCTGAACCACAGCTGGGACAACGCGGCCCGGGGCCGGCGCATCACCATCGCGCGCACGCCGCTCGTCGGCCGCTCGACGCGCATCTTCACCATCGGCAGCTGCTTCGCCATGGAAATCCGCCGCCAGCTGCAGTCGGGCGGCTACCGCTCGCTGCCGGATTTCAGCGAGGTGAAGATCGACCGCGCGCACCAGTTCGCCGGCGGCATCCCCGACAACGAGCGCTTCGTCTACTACGACACCTTCACCATCCGCCAGGAGTTCGACAAGGCCTTCGGCCTGTGGGACCAGGACGCGGACTCCTACTGGAGCATGACCGACCGGCCGATCAACCGGAACAACAAGTGGCCGGTGGTGTACCAGGACCCGCACCGCAAGCTCTGCTTCGCCGACAGCCACGCGGGCAGCCGTCTCGGTCCGGGCGCCGCGCAGCTCGTCGAAGCGGGCGATGCCGAGGTCGATGAGCACCGCGTCTCCCGACGGGGCCACGATGATGTTGCGCGGTGA

一、bioedit的下载

BioEdit Download - Research software utility for creating and editing biological sequences

二、序列的导入与分析

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(1)分子质量、碱基组成和碱基分布

DNA molecule: k127_305768_1
Length = 519 base pairs
Molecular Weight = 159274.00 Daltons, single stranded
Molecular Weight = 317143.00 Daltons, double stranded
G+C content = 68.21%
A+T content = 31.79%

Nucleotide Number Mol%
A 93 17.92
C 188 36.22
G 166 31.98
T 72 13.87

image-20220520110552251

(2)给出相应的转换,例如DNA 转换成RNA,翻译成蛋白质序列

image-20220520110715059

image-20220520110736817现在是RNA,然后再切换回DNA再做下一题。

切换就用RNA->DNA

而翻译成蛋白质则使用

image-20220520111042018

image-20220520111131926

三、Primer Premierv5.00的下载

Premier破解版-Primer Premier 5破解版下载(附破解教程+使用教程) v5.00 - 软件学堂

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四、序列的导入与分析

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(3)分析基因所包含的限制性内切酶位点

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(4)如何设计引物并将基因克隆到特定载体上(质粒,pET28a)

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设计好参数后,找到44对引物,挑选合适的引物进行基因工程的那一套操作流程,即合成引物,PCR扩增,合成目的基因,导入到特定载体中,验证。


文章作者: Cling
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