生物信息学作业-520-bioedit&PrimerPrimer5
问答题:(1)分析所给核酸序列(基因)的组分,主要包括分子质量、碱基组成和碱基分布
等;(2)给出相应的转换,例如DNA 转换成RNA,翻译成蛋白质序列;(3)分析基因所包
含的限制性内切酶位点;(4)如何设计引物并将基因克隆到特定载体上(质粒,pET28a)?
>k127_305768_1
ATGAGCGCGAAGCCGCTGAACCACAGCTGGGACAACGCGGCCCGGGGCCGGCGCATCACCATCGCGCGCACGCCGCTCGTCGGCCGCTCGACGCGCATCTTCACCATCGGCAGCTGCTTCGCCATGGAAATCCGCCGCCAGCTGCAGTCGGGCGGCTACCGCTCGCTGCCGGATTTCAGCGAGGTGAAGATCGACCGCGCGCACCAGTTCGCCGGCGGCATCCCCGACAACGAGCGCTTCGTCTACTACGACACCTTCACCATCCGCCAGGAGTTCGACAAGGCCTTCGGCCTGTGGGACCAGGACGCGGACTCCTACTGGAGCATGACCGACCGGCCGATCAACCGGAACAACAAGTGGCCGGTGGTGTACCAGGACCCGCACCGCAAGCTCTGCTTCGCCGACAGCCACGCGGGCAGCCGTCTCGGTCCGGGCGCCGCGCAGCTCGTCGAAGCGGGCGATGCCGAGGTCGATGAGCACCGCGTCTCCCGACGGGGCCACGATGATGTTGCGCGGTGA
一、bioedit的下载
BioEdit Download - Research software utility for creating and editing biological sequences
二、序列的导入与分析
(1)分子质量、碱基组成和碱基分布
DNA molecule: k127_305768_1
Length = 519 base pairs
Molecular Weight = 159274.00 Daltons, single stranded
Molecular Weight = 317143.00 Daltons, double stranded
G+C content = 68.21%
A+T content = 31.79%
Nucleotide Number Mol%
A 93 17.92
C 188 36.22
G 166 31.98
T 72 13.87
(2)给出相应的转换,例如DNA 转换成RNA,翻译成蛋白质序列
现在是RNA,然后再切换回DNA再做下一题。
切换就用RNA->DNA
而翻译成蛋白质则使用
三、Primer Premierv5.00的下载
Premier破解版-Primer Premier 5破解版下载(附破解教程+使用教程) v5.00 - 软件学堂
四、序列的导入与分析
(3)分析基因所包含的限制性内切酶位点
(4)如何设计引物并将基因克隆到特定载体上(质粒,pET28a)
设计好参数后,找到44对引物,挑选合适的引物进行基因工程的那一套操作流程,即合成引物,PCR扩增,合成目的基因,导入到特定载体中,验证。